指数を高い順から馬券を購入しても勝ち組には行けません。

指数の根本は走破タイムにあります。
基本的に走破タイムが速ければ指数は高く、遅ければ低くなります。
（馬場指数や斤量補正なども行います）

ところが、スローペースになってしまうと走破タイムも平凡になり当然指数も低くなります。
特に長距離のレースではこの傾向が強くなります。

指数は全馬が何の不利もなく、最後まで全力で走ると言うことを前提条件にしています。

お気づきだと思いますが道中で受けた不利、出遅れ、着外馬の最後の流した走りなどは基本的には指数に反映されていません。
これが指数通り馬券を購入しても当たらない一つの要因となっています